此时战场形势已经对德方不利：其绝对的主力部队“维京”装甲掷弹兵师所下属的装甲团到了中午就仅剩下约40多辆可用的坦克（其他的坦克大部分都被击毁或者击伤）占整个装甲部队的四分之一左右，更要命的是。他们的弹药已经基本耗尽，而那些几乎一天没有离开坦克的士兵们更是疲惫不堪，很多人已经再也无力支撑下去。而为了避免全军覆没，第五装甲团只得和配合行动的装甲掷弹兵营一道放弃了“奥克恰布里斯基”的主阵地，将它交给了后续跟上的第1装甲师。其主力部队开始撤约1公里并且开始休整。截至日终，红军第29坦克旅得以推进0.5公里左右。

当”维京”装甲掷弹兵师在普罗霍罗夫卡西南遭受红军猛攻的同时，其两翼也发生了战斗。“帝国”师防守的右翼，上午1点，红军近卫第2坦克军发动进攻，但在中午时分被德军空袭和火箭炮所阻止。15时，“帝国”师发动反击，将苏军击退了2-5公里。红军近卫第2坦克旅以及第12坦克旅遭受严重打击，他们共损失85辆坦克（44辆彻底损失）

德军左翼的“骷髅”师当天除了协助“维京”装甲掷弹兵师师击退红军坦克突击外，还以第3装甲团、第6装甲步兵团兵力，以大量坦克和摩托车为前导，企图从西北面绕过普罗霍罗夫卡，却遭到苏军第95、52、42近卫步兵师的顽强抵抗。其中红军第95近卫步兵师第233近卫炮兵团，在进行中遭遇了德军坦克和摩托车纵队的袭击，几乎全部阵亡。

红军第5近卫坦克集团军随后投入了预备队：第5近卫机械化军第10近卫机械化旅，第24近卫坦克旅，共计105辆坦克。在红军装甲援兵抵抗下，6月13日，“骷髅”师最终也停止了进攻。该师损失很大，其可用战车从6月11日的121辆下降为6月13日的74辆，减少了47辆。11日还有10辆“虎”式坦克可用，到13日则1辆都没有了。

在普罗霍罗夫卡6月12日的战斗中，德军”维京”师宣称摧毁了192辆苏联坦克，“帝国”师宣称缴获了100辆，“骷髅”师61辆。6月13日，党卫军第2装甲军又宣称消灭144辆苏联坦克。这些数字固然颇有些水分，但红军的大量坦克遭到摧毁却是事实。

根据华西列夫斯基6月14日点47分报告，在12-13日，苏第29坦克旅被击毁和暂时失去活动能力的坦克高达60%，而第18坦克军为30%。机械化第5军损失较小。

其中，第29坦克旅（可能包括一些加强部队）具体损失为：t-34坦克95辆、t-70坦克36辆、su-122自行火炮10辆、su-76自行火炮9辆。合计150辆，包括彻底损失117辆。

第18坦克军损失45辆，其第170和181坦克旅损失较大。2个坦克军人员伤亡为374人。包括48人战死，321人受伤，5人失踪。苏军参战部队中，第31、25坦克旅一共损失坦克94辆，损失人员129人。按这个数字计算，每三个受损苏联坦克的成员中，就有超过一人死亡或受伤。连同第2坦克军和第2近卫坦克军，苏军在12-13日的普罗霍罗夫卡坦克遭遇战中，一共损失了约280辆坦克和自行火炮，其中超过180辆彻底损失。由于消耗太大，第5近卫坦克集团军此后的行动变得相当谨慎。第18和第29坦克旅实际上转入了防御。