局势向英国一边倾斜，清军虽然入藏，但西藏当地并未心服。在获悉**出逃后。英国方面却如获至宝，处处加以笼络。英印总督明托、英国驻锡金政务官柏尔等人多次会见**，为他打气。不到两年。**与随员已完全倾向英国。
辛亥武昌起义爆发的消息传至西藏后，藏局果然开始再次动荡。先是驻藏清军因欠饷而军心浮动，军中会党分子乘机闹事，后是革命消息传来，有人以弃藏回川为号召煽动起事。1911年11月，郭圆珍等人领导兵变，囚禁联豫，被钟颍击败，由于紧接着清廷退位。联豫称病休养，藏事由钟颍主持（1912年5月，袁世凯正式任命其为驻藏办事长官）。但是，不久之后征讨波密大军于撤退途中闹事抢劫，接着与藏军发生纠纷，并波及江孜、日喀则等地。再后来，拉萨市内的汉藏冲突亦因驻军劫掠寺庙而激化（中央欠饷，驻军不得已而为之）。汉藏之间的冲突，本来就有根源。更加之清政府民族压迫，并没有多少可以奇怪的，但是英国如同嗅到了臭味的苍蝇，拼命要来横插一杠，在他们的怂恿和挑唆下，居然掀起了“西**立”的喧嚣。
卸任不久的英印总督与**密谈，让其派遣官员潜回西藏进行煽动，并由**的内侍达桑占东（亲英分子）负责具体组织军事叛乱，这家伙组织了一支一万多人地藏军。PaoShu８自任总司令。开始对江孜守军发起进攻，经过英国驻亚东商务委员麦克唐纳的“调停”。当地驻军被迫交出枪枝弹药取道印度回国，随即，日喀则的驻军也遭到同样地命运（英国可是一贯拉偏架的老手）。扫荡外围完毕后，达桑占东又率领各路叛军围攻拉萨，与守军展开激战，由于械饷两缺，兼之得不到当地民众的，再加上英国方面上窜下跳，守军的处境越来越不利，不得已只好接受了英国的“调停”，和藏军达成四点“议和条件”，将枪弹交出，经印度返回国内，只留下驻藏官员留驻拉萨，但随着驻藏军队陆陆续续撤出，远在印度的**喇嘛在英国的鼓动下，强令所有留藏官员也必须撤出拉萨，钟颍在失去军队护卫后，也只能被迫离开拉萨，到1913年2月，所有驻藏官员和军队都被西藏地方的分裂势力驱逐出境。
英国方面见阴谋得逞，迫不及待地将已经在印度流亡了两年多的**护送回藏有了英国人地保证，西藏亲英分裂主义势力更为猖狂。在城内，他们挑动民族仇恨，煽动要把汉人“驱逐净尽”。在藏边，藏军东进，切断川藏交通，到6月中旬，先后攻陷江卡、盐井、理塘等地。包围了察木多、康定等地。川边末被攻陷的县城，南路只有三个县，北路尚余八个县，由此直接威胁到川、滇两省的安全。
南京临时政府成立时，孙中山虽已明确宣告西藏为中华民国领土，但限于实力，根本无力干涉。袁世凯任总统后，面对当时的西藏局势，决定对藏政策是剿抚结合，先剿后抚。对袁世凯来说，他最重要的任务是稳定局势，打压国民党，只要不出动北洋军队而让川、滇两省出兵，既可免伤实力，又可削平藏乱，自然是件好事。
先是川督尹昌衡亲率川军前队二千五百人从成都出发，兵分两路，南路由朱森林率领，收复河口、理塘，北路由刘瑞麟率领，解了察木多、巴塘之围。与此同时，蔡锷派遣的支队也收复了盐井等地，藏军人数虽多，但实力其实不强，基本是一群乌合之众，在西藏内陆还可以依靠熟悉地形、有利环境而得到，到了川边失去这些依托后，就变成不堪一击。
川、滇军队节节胜利的消息，使西藏分裂主义势力的后台老板——英国终于忍耐不住了。它放弃了所谓“不干涉政策”，开始走上前台**裸地干涉中国内政。朱尔典曾与袁世凯会谈，就中国迫切需要大借款这一困境来提醒袁注意，如果川军的进兵超出一定范围，英国政府就不会对中国提供任何进——步地援助，进而声称“西藏问题总以日后和商易为归结，倘现时用武力，或与友睦之办法必有巨碍”。
此后朱尔典又几次重提中国不得派兵入藏，不得改西藏为行省，否则所有责任惟中国是问，在这些威胁——时未见效而藏军在川、滇军兵锋之下不断败退的情况下，8月17日，英国方面正式向中国提交照会，声明五点：一、英政府不允中国干涉西藏内政；二、反对华官在藏擅夺行政权并不承认中国视西藏与内地各省平等；三、英国不允在西藏境内存留无限华兵；四、以上各节先行立约，英方将承认之意施于民国；五、暂时中藏经过印度之交通应视为断绝。英国的照会完全无视国际法堆则，是对一个主权国家内政明日张胆的干涉。但是袁世凯政府迫切要求得到列强承认和借款，迫切希望镇压“二次革命”，不敢轻易与英决裂。秦时竹发动护国战争后，朱尔典变本加厉，更进一步威胁中国，如果中国政府不令川军停止西进，英国不仅不承认中国政府，而且将以实力助**立。
面对英国的强硬态度，有求于列强的袁世凯终于抗衡不住，致电尹昌衡、蔡锷，胡说什么“切不可冒昧轻进，致酿交涉，摇动大局”。当时，川、滇两军的形势还较为有利，但接到中央之命令，也只能服从，川、滇军基本停止于怒江一线。有人评论说：“战胜川军者，非藏兵也，英使朱尔典也。”
秦时竹上台后，从不同渠道得悉了这些消息，当时因为英国方面忙于其他更大的事务（与江南的冯国璋勾结），无暇要挟秦时竹做出更大地让步，才暂时地没有提到西藏事务，但秦时竹不敢掉以轻心，要知道，按照历史逻辑地发展，1914会有西姆拉会议和麦克马洪线，他决心在事态还没有发展到那一步前，先行抑制住英国的侵略野心。派遣张孝准入川，一方面是为了平定川乱，另一方面也有威慑西藏分裂势力地意图，在这样的情况下，蔡锷的地位便显得愈发重要了。